药师坛城是秉承药师佛十二大愿精神，为解除众生诸多疾苦而发起建设，将依据《药师琉璃光如来本愿功德经》供奉药师坛城，建成之后将通过药师法门与传统中医药的实践行愿，帮助社会大众实现身心灵整体健康为终极目标，药师坛城的建设过程中，是秉承药师佛十二大愿的引导下，祈愿社会大众发菩提心，行愿一致、同愿同行、同沾法喜、同成佛道。

坛城中本尊释迦牟尼佛正面端坐，围绕着药师七如来、八大菩萨，左右两边日光月光二肋侍及十二神将。殿内四周供奉着药师琉璃佛，金色琉璃世界，充满着流光溢彩的琉璃净土之庄严。